La Clinica Neurochirurgica è ubicata nel Padiglione E del Policlinico Universitario "Gaetano Martino".

L'Azienda Ospedaliera Universitaria "Gaetano Martino" si trova in località Gazzi, a Messina, in Via Consolare Valeria 1, in un'area servita dalla linea del Tram dell'A.T.M., dalla Tangenziale e da numerose linee di autobus. 

Due ingressi, entrambi sulla Via Consolare Valeria, consentono l'accesso all'Azienda Ospedaliera Universitaria. 

Per la mobilità interna, l'Azienda mette a disposizione un proprio servizio di Mini-Bus interno, con trasporto gratuito, attivo tutti i giorni dalle 8:00 alle 18:00 (il sabato fino alle 13:00), che effettua il percorso tra l'ingresso principale (vicino al Pronto Soccorso) e i vari edifici interni, e viceversa, con percorrenza ogni 15 minuti circa. 

Il servizio gratuito di bus "Polibus" è riservato sia agli utenti visitatori (Linea Rossa) sia agli studenti (Linea Blu) e serve tutta l'area della struttura ospedaliera.